Η διδασκαλία του Ηρακλείτου σηματοδοτεί την επανερμηνεία των παραδοσιακών θρησκευτικών - μυθολογικών παραστάσεων των αρχαίων Ελλήνων. Αυτή αποτέλεσε ένα από τα στάδια διαμόρφωσης της φιλοσοφίας στο δικό της δρόμο ανάπτυξης, τη σημαντική απελευθέρωση της φιλοσοφίας από τις παραδοσιακές λαϊκές παραστάσεις για τον κόσμο, τους θεούς και την ίδια τη ζωή. Λέμε "σημαντική απελευθέρωση" επειδή ο Ηράκλειτος χρησιμοποιεί συχνά τις μορφές της λαϊκής μυθολογίας και της θρησκείας για να διατυπώσει τις ιδέες του.